Похоже, что 68001 - это то, что Вам нужно - физический уровень USB-2.0 так что замена позволит не программировать лишний процессор.

Если мне не изменяет склероз, XCV600 - это семейство Virtex, 600000 вентилей, один из старших кристаллов, ресурсов которого достаточно для весьма "тяжелых" задач в том числе и для размещения собственного процессора для управленя устройством.